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由于在现实生活中太过不顺，加上空地也无法玩耍，大雄和他的伙伴小夫、胖虎和静香决定进行史上最大规模的离家出走。同时，由于发生时空错乱，一名名叫古古儿的远古时代中国人来到20世纪的东京，后被大雄等发现，带到七万年前。原来古古儿所在的光明族被黑暗族侵略，而黑暗族的首领是来自未来世界的巨尊比，他妄图改变世界历史，但是在时光巡逻队的协助下，最后巨尊比的阴谋破产，而古古儿和他的部族来到了日本，成为日本人的始祖。舞台在七万年前的中国。

东京出身的女子高中生 松前绪花 入住了祖母经营的温泉旅馆“喜翠庄”。在与见习厨师鹤来民子和见习仲居押水菜子度过的日子中，习惯了喜翠庄生活的绪花渐渐开始注意到的自身的变化。深秋的某天，同班同学、竞争对手“福屋”旅馆的女儿 和仓结名来到了喜翠庄进行女将修行。一边被自由奔放的结名弄的不知所措、又一边照顾她的绪花，在打扫的时候，在杂物柜中发现的某个东西。

木之本樱，是擅长体育的小学4年级学生。某天，小樱从学校回家，在平常都没有人的地下书房发现似乎有什么人的样子。小樱走下去一看，那里有一本闪耀着金色光芒的书。里面装有牌，然而，在读写在上面的文字的时候，刮来了剧烈的风，牌四处飞散开去。从书的最后，出现了名为可鲁贝洛斯的奇妙生物，书中写着库洛牌的封印被解开之时，灾难就会降临世间之类的话。随后，可鲁贝洛斯将封印的钥匙交给了小樱，令她成为收复牌的魔卡捕获者。当晚，小樱用魔法与实体化的魔卡对决……

　　18世纪上半叶，日本正处在德川幕府时代。只能向将军贡献腌萝卜的蕞尔穷藩汤长谷藩刚刚完成一年一度劳民伤财的参勤交代，藩主内藤政醇（佐佐木藏之介 饰）原打算好好休息一下，谁知幕府老中松平信祝（阵内孝则 饰）获悉汤长谷藩发现金山，因此他设计迫使内藤必须于五日之内再度参勤，否则 将以谋反论处。明知这是一场处心积虑的阴谋，但是内藤还是决定铤而走险。在善于出谋划策的家老相马兼嗣（西村雅彦 饰）以及户隐流忍者云隐段藏（伊原刚志 饰）等人的协助下，汤长谷藩的绝命参勤正式展开。与此同时，狡猾的松平信祝接连派出密探，企图

幕府时代末期，外忧内患，山河动荡，百姓生活困苦，且生命时刻受到威胁。少年心太因其善良纯洁之心感动飞天御剑流高手比古清十郎，被其收入门下学习剑法，更名剑心。在国家危难之际，年轻的剑心怀揣改变时代的梦想下山，加入奇兵队，日后更被桂小五郎纳入麾下，以刽子手的身份为时代的变革尽一份绵薄之力。年仅15岁的剑心接连刺杀多名政府要员，令对手闻风丧胆，直到某一天，一名下级武士在他的脸上留下一道无法愈合的伤疤。来至京都寻找爱人的雪代巴邂逅了剑心，正是眼前这名瘦弱的男子将爱人从她的生命中带走。巴走入剑心的生活，随之经历了政治

何雨因不满上司灰色操作惨遭“被离职”，被迫跟同名同姓的青年小雨住到了同一屋檐下。在没有工作的一年中，两个理念迥异的女孩互相依靠，互相改变，抛弃打鸡血的生活方式，找到了内心的平静。两人从对方身上领悟到生活和工作的意义。不够“成功”，也可以很幸福。屡战屡败的人生，也怀有希望。

本作是上世纪经典名作《魔卡少女樱》的第一部剧场版作品，以香港作为背景舞台，观影人数创下当时的记录，并获得第四届神户动画作品大赏的剧场赏。

原作コミックス「カードキャプターさくら クリアカード編」第3巻DVD付き特装版の発売が決定しました。2018年1月からのTVアニメ放送に先駆けて、「さくら」の新作アニメーションが「封印解除」――！PVも公開中です。「さくらカード編」と「クリアカード編」をつなぐストーリー、ぜひご期待ください。